Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XIRP2A4UGR9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XIRP2A4UGR9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms