Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cldn34dA2AGU5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms