RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000121834.7

Syt6-205, Transcript of Synaptotagmin-6, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Syt6, Length 1,710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Gm35339	A0A140LHH9	1649 aa		44	■■■■■ 4.63
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Nisch	Q80TM9	1593 aa		43.61	■■■■■ 4.57
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Abcc9	P70170	1546 aa		42.23	■■■■■ 4.35
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Abcc8	B2RUS7	1588 aa		41.99	■■■■■ 4.31
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Scrib	Q80U72	1612 aa		40.26	■■■■■ 4.04
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Kdm5d	Q62240	1548 aa		39.02	■■■■□ 3.84
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Nacad	Q5SWP3	1504 aa		39	■■■■□ 3.83
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Dcaf1	Q80TR8	1506 aa		38.75	■■■■□ 3.79
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Sycp2	Q9CUU3	1500 aa		38.21	■■■■□ 3.71
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Rhox8	Q6VSS7	320 aa		38.18	■■■■□ 3.7
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Rb1cc1	Q9ESK9	1588 aa		38.09	■■■■□ 3.69
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Bicra	F8VPZ9	1578 aa		37.64	■■■■□ 3.62
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Ccdc180	J3QNE4	1664 aa		37.64	■■■■□ 3.62
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Baz1a	O88379	1555 aa		37.55	■■■■□ 3.6
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Crybg2	B7ZCC2	1516 aa		37.25	■■■■□ 3.55
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Zcchc6	Q5BLK4	1491 aa	Known RBP	36.93	■■■■□ 3.5
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Rtl1	Q7M732	1744 aa		36.52	■■■■□ 3.44
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Smarca2	Q6DIC0	1577 aa		36.49	■■■■□ 3.43
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Pds5b	Q4VA53	1446 aa	Known RBP	36.44	■■■■□ 3.42
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Dnajc5b	Q9CQ94	199 aa		36.39	■■■■□ 3.42
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Atad2b	E9Q166	1460 aa	Known RBP	36.19	■■■■□ 3.38
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Cecr2	E9Q2Z1	1453 aa		36.16	■■■■□ 3.38
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Smarca4	Q3TKT4	1613 aa	Known RBP	36.15	■■■■□ 3.38
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Thoc2	B1AZI6	1594 aa	Known RBP	36.02	■■■■□ 3.36
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Iqgap2	Q3UQ44	1575 aa		35.89	■■■■□ 3.34
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Ercc6	F8VPZ5	1481 aa		35.74	■■■■□ 3.31
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Ccdc136	Q3TVA9	1136 aa		35.65	■■■■□ 3.3
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Cc2d2a	Q8CFW7	1633 aa		35.49	■■■■□ 3.27
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Wdr62	Q3U3T8	1523 aa		35.48	■■■■□ 3.27
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Brd4	Q9ESU6	1400 aa	Known RBP	35.47	■■■■□ 3.27
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Synj1	Q8CHC4	1574 aa		35.45	■■■■□ 3.27
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Cttnbp2	B9EJA2	1648 aa		35.45	■■■■□ 3.27
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Frmpd1	A2AKB4	1549 aa		35.42	■■■■□ 3.26
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Cftr	P26361	1476 aa		35.41	■■■■□ 3.26
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Fam135a	Q6NS59	1506 aa		35.26	■■■■□ 3.24
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Unc13a	Q4KUS2	1712 aa		35.12	■■■■□ 3.21
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Trim41	Q5NCC3	630 aa		35.08	■■■■□ 3.21
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Phldb1	Q6PDH0	1371 aa	Known RBP	35.08	■■■■□ 3.21
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Esf1	Q3V1V3	845 aa	Known RBP	34.89	■■■■□ 3.18
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Baz1b	Q9Z277	1479 aa		34.78	■■■■□ 3.16
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Ubl4b	Q9CQ84	188 aa		34.77	■■■■□ 3.16
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Mrc2	Q64449	1479 aa		34.44	■■■■□ 3.1
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Rsf1	E9PWW9	1441 aa	Known RBP	34.41	■■■■□ 3.1
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Golga3	P55937	1487 aa		34.4	■■■■□ 3.1
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Top2b	Q64511	1612 aa		34.37	■■■■□ 3.09
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Kif15	Q6P9L6	1387 aa		34.32	■■■■□ 3.09
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Cngb1	E1AZ71	1325 aa		34.32	■■■■□ 3.08
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Lamc3	Q9R0B6	1581 aa		34.31	■■■■□ 3.08
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Cux2	P70298	1426 aa		34.18	■■■■□ 3.06
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Tnn	Q80Z71	1560 aa		34.08	■■■■□ 3.05
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Fmn1	Q05860	1466 aa		33.93	■■■■□ 3.02
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Kif21a	Q9QXL2	1672 aa		33.91	■■■■□ 3.02
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Npm1	Q61937	292 aa	Known RBP	33.87	■■■■□ 3.01
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Ccdc18	Q640L5	1455 aa		33.79	■■■■□ 3
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Cep164	Q5DU05	1446 aa		33.79	■■■■□ 3
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Camsap1	A2AHC3	1581 aa		33.77	■■■■□ 3
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Lrriq1	Q0P5X1	1673 aa		33.75	■■■□□ 2.99
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Il27	Q8K3I6	234 aa		33.74	■■■□□ 2.99
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Ccdc88b	Q4QRL3	1481 aa		33.62	■■■□□ 2.97
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Lrpprc	Q6PB66	1392 aa	Known RBP	33.51	■■■□□ 2.95
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Dhx29	Q6PGC1	1365 aa	Known RBP	33.49	■■■□□ 2.95
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Chic1	Q8CBW7	227 aa		33.42	■■■□□ 2.94
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Crocc2	F6XLV1	1638 aa		33.42	■■■□□ 2.94
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Top2a	Q01320	1528 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.94
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Pogz	Q8BZH4	1409 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Urb2	E9Q7L1	1524 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Grin2b	Q01097	1482 aa		33.32	■■■□□ 2.92
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Plb1	Q3TTY0	1478 aa		33.29	■■■□□ 2.92
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Duox2	A2AQ99	1517 aa		33.24	■■■□□ 2.91
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Eif4g3	Q80XI3	1579 aa	Known RBP	33.24	■■■□□ 2.91
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Hrc	G5E8J6	738 aa		33.19	■■■□□ 2.9
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Nrk	Q9R0G8	1455 aa		33.06	■■■□□ 2.88
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Efcab5	A0JP43	1406 aa		33.04	■■■□□ 2.88
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Samd9l	Q69Z37	1561 aa		33.03	■■■□□ 2.88
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Ift140	E9PY46	1464 aa		33.03	■■■□□ 2.88
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Shroom4	Q1W617	1475 aa		32.95	■■■□□ 2.87
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Ptprk	P35822	1457 aa		32.92	■■■□□ 2.86
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Dnajc5	P60904	198 aa		32.91	■■■□□ 2.86
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Disp1	Q3TDN0	1521 aa		32.86	■■■□□ 2.85
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Setd1b	Q8CFT2	1985 aa		32.86	■■■□□ 2.85
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Rusc2	Q80U22	1514 aa		32.84	■■■□□ 2.85
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Pbrm1	Q8BSQ9	1634 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Rad54l2	Q99NG0	1466 aa		32.78	■■■□□ 2.84
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Gab3	Q8BSM5	595 aa		32.74	■■■□□ 2.83
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Shroom2	A2ALU4	1481 aa		32.71	■■■□□ 2.83
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Npm2	Q80W85	207 aa		32.7	■■■□□ 2.83
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Nup160	Q9Z0W3	1402 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Synm	Q70IV5	1561 aa		32.67	■■■□□ 2.82
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Magi3	Q9EQJ9	1476 aa		32.65	■■■□□ 2.82
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Grin2a	P35436	1464 aa		32.65	■■■□□ 2.82
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Zeb1	Q64318	1117 aa		32.64	■■■□□ 2.82
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Cc2d2b	A0A286YDU8	1405 aa		32.61	■■■□□ 2.81
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Rapgef2	Q8CHG7	1496 aa		32.55	■■■□□ 2.8
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Mroh2b	Q7M6Y6	1581 aa		32.53	■■■□□ 2.8
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Pla2r1	Q62028	1487 aa		32.52	■■■□□ 2.8
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Aqr	Q8CFQ3	1481 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Gpatch8	A2A6A1	1505 aa		32.45	■■■□□ 2.79
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Arhgap35	Q91YM2	1499 aa		32.4	■■■□□ 2.78
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Pabpn1	Q8CCS6	302 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
Syt6-205	ENSMUST00000121834	Eif4g1	Q6NZJ6	1600 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77

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