Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POTEB3A0JP26 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEB3A0JP26 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms