Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBA6A0AVT1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBA6A0AVT1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms