Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRI6

CENPVL3, Centromere protein V-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPVL3A0A0U1RRI6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPVL3A0A0U1RRI6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPVL3A0A0U1RRI6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPVL3A0A0U1RRI6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms