Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A0U1RQJ8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms