Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0D9SFI3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0D9SFI3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms