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| PTPRJ | Q12913 | MAD2L1BP-201 | ENST00000372171 | 1301 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.61 | □□□□□ -0.39 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PCDHGB2-201 | ENST00000522605 | 4602 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.61 | □□□□□ -0.39 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ARMT1-204 | ENST00000545879 | 2495 nt | TSL 2 BASIC | 12.61 | □□□□□ -0.39 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MAGEC2-201 | ENST00000247452 | 1991 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.61 | □□□□□ -0.39 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC092279.1-202 | ENST00000597683 | 1966 nt | TSL 2 BASIC | 12.61 | □□□□□ -0.39 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ASB11-203 | ENST00000480796 | 1484 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.61 | □□□□□ -0.39 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | C16orf82-202 | ENST00000505035 | 2459 nt | APPRIS P5 BASIC | 12.61 | □□□□□ -0.39 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | PLA2G1B-201 | ENST00000308366 | 565 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.61 | □□□□□ -0.39 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GLULP4-201 | ENST00000324731 | 1122 nt | BASIC | 12.61 | □□□□□ -0.39 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | SARNP-201 | ENST00000336133 | 926 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.61 | □□□□□ -0.39 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | AC002351.1-201 | ENST00000546852 | 590 nt | TSL 2 BASIC | 12.61 | □□□□□ -0.39 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | NOP16-207 | ENST00000614830 | 1258 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.61 | □□□□□ -0.39 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SEC31A-208 | ENST00000448323 | 4255 nt | APPRIS P4 TSL 5 BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ANKLE2-208 | ENST00000542282 | 3302 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZNF730-202 | ENST00000597761 | 2374 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | TCHP-202 | ENST00000405876 | 3090 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SEPT9-204 | ENST00000427180 | 3635 nt | TSL 2 BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | ESRP2-210 | ENST00000565858 | 3386 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | SLC4A5-205 | ENST00000394019 | 6348 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NR1I2-201 | ENST00000337940 | 2743 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
| PTPRJ | Q12913 | G2E3-202 | ENST00000438909 | 2334 nt | TSL 2 BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | AC073578.3-201 | ENST00000624926 | 4191 nt | BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TCERG1-202 | ENST00000394421 | 3633 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | CDC37L1-201 | ENST00000381854 | 3502 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ENPP5-201 | ENST00000230565 | 2544 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CDH11-201 | ENST00000268603 | 6857 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZER1-201 | ENST00000291900 | 4259 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
| PTPRJ | Q12913 | UMODL1-205 | ENST00000408910 | 4878 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | ZNF18-202 | ENST00000454073 | 2261 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SPATA6-203 | ENST00000371847 | 4973 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | SLC4A7-203 | ENST00000425128 | 7970 nt | TSL 5 BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | POLR3C-201 | ENST00000334163 | 1851 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | IGFL4-201 | ENST00000377697 | 573 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | AP003692.1-202 | ENST00000510185 | 502 nt | TSL 3 BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LINC01099-202 | ENST00000512527 | 578 nt | TSL 2 BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LMO3-211 | ENST00000534946 | 1016 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AP003785.1-201 | ENST00000544959 | 492 nt | TSL 4 BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LAMTOR1-208 | ENST00000545249 | 965 nt | TSL 3 BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC008567.1-201 | ENST00000567299 | 1192 nt | BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC091132.3-201 | ENST00000579701 | 470 nt | BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC138645.1-201 | ENST00000582765 | 470 nt | BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CDRT1-207 | ENST00000583965 | 562 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.6 | □□□□□ -0.39 | | |