Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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ARL2-SNX15V9GYD0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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ARL2-SNX15V9GYD0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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ARL2-SNX15V9GYD0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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ARL2-SNX15V9GYD0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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ARL2-SNX15V9GYD0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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ARL2-SNX15V9GYD0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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ARL2-SNX15V9GYD0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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ARL2-SNX15V9GYD0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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ARL2-SNX15V9GYD0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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ARL2-SNX15V9GYD0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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ARL2-SNX15V9GYD0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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ARL2-SNX15V9GYD0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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ARL2-SNX15V9GYD0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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