Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y512

SAMM50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMM50Q9Y512 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SAMM50Q9Y512 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SAMM50Q9Y512 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms