Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHKBQ9Y259 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHKBQ9Y259 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHKBQ9Y259 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHKBQ9Y259 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHKBQ9Y259 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHKBQ9Y259 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHKBQ9Y259 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHKBQ9Y259 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHKBQ9Y259 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHKBQ9Y259 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms