Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIGD1AQ9Y241 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HIGD1AQ9Y241 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms