Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4E1Q9UPM8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms