Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MKLN1Q9UL63 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MKLN1Q9UL63 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKLN1Q9UL63 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MKLN1Q9UL63 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms