Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA2Q9UL42 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA2Q9UL42 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms