Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO4Q9UKT5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO4Q9UKT5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms