Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PARP4Q9UKK3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PARP4Q9UKK3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PARP4Q9UKK3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms