Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP3Q9UKI2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms