Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRTO4Q9UKD2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MRTO4Q9UKD2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms