Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDH22Q9UJ99 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH22Q9UJ99 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms