Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MBD1Q9UIS9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms