Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms