Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHORDC1Q9UHD1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms