Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SWAP70Q9UH65 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SWAP70Q9UH65 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms