Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXF1Q9UBU9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms