Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1D8

PRO2289, Putative uncharacterized protein PRO2289, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRO2289Q9P1D8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
PRO2289Q9P1D8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms