Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EHD3Q9NZN3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms