Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDE1Q9NZC3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDE1Q9NZC3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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