Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYC9

DNAH9, Dynein heavy chain 9, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 4,486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAH9Q9NYC9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAH9Q9NYC9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAH9Q9NYC9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAH9Q9NYC9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAH9Q9NYC9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAH9Q9NYC9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DNAH9Q9NYC9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAH9Q9NYC9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAH9Q9NYC9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAH9Q9NYC9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAH9Q9NYC9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DNAH9Q9NYC9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DNAH9Q9NYC9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms