Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D2Q9NY47 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA2D2Q9NY47 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms