Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
KLHL28Q9NXS3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLHL28Q9NXS3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms