Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM248Q9NWD8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM248Q9NWD8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM248Q9NWD8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM248Q9NWD8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM248Q9NWD8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM248Q9NWD8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM248Q9NWD8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM248Q9NWD8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM248Q9NWD8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM248Q9NWD8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM248Q9NWD8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM248Q9NWD8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM248Q9NWD8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM248Q9NWD8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM248Q9NWD8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms