Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARVAQ9NVD7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms