Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM30AQ9NV96 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM30AQ9NV96 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM30AQ9NV96 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms