Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCM2LQ9NUG4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCM2LQ9NUG4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCM2LQ9NUG4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCM2LQ9NUG4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCM2LQ9NUG4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCM2LQ9NUG4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCM2LQ9NUG4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCM2LQ9NUG4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCM2LQ9NUG4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCM2LQ9NUG4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCM2LQ9NUG4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCM2LQ9NUG4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCM2LQ9NUG4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCM2LQ9NUG4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCM2LQ9NUG4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCM2LQ9NUG4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCM2LQ9NUG4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCM2LQ9NUG4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCM2LQ9NUG4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCM2LQ9NUG4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCM2LQ9NUG4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCM2LQ9NUG4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCM2LQ9NUG4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCM2LQ9NUG4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCM2LQ9NUG4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCM2LQ9NUG4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCM2LQ9NUG4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCM2LQ9NUG4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms