Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREX1Q9NSU2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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