Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TNFRSF19Q9NS68 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFRSF19Q9NS68 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms