Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX15Q9NRS6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms