Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TULP4Q9NRJ4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TULP4Q9NRJ4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms