Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPHNQ9NQX3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GPHNQ9NQX3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPHNQ9NQX3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms