Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB3Q9NQW8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB3Q9NQW8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB3Q9NQW8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB3Q9NQW8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB3Q9NQW8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB3Q9NQW8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB3Q9NQW8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB3Q9NQW8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB3Q9NQW8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB3Q9NQW8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNGB3Q9NQW8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB3Q9NQW8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB3Q9NQW8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB3Q9NQW8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB3Q9NQW8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB3Q9NQW8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB3Q9NQW8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB3Q9NQW8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNGB3Q9NQW8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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