Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLRC4Q9NPP4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms