Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPHS2Q9NP85 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPHS2Q9NP85 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPHS2Q9NP85 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPHS2Q9NP85 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPHS2Q9NP85 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPHS2Q9NP85 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPHS2Q9NP85 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPHS2Q9NP85 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPHS2Q9NP85 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPHS2Q9NP85 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPHS2Q9NP85 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPHS2Q9NP85 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPHS2Q9NP85 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPHS2Q9NP85 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPHS2Q9NP85 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPHS2Q9NP85 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPHS2Q9NP85 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPHS2Q9NP85 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPHS2Q9NP85 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPHS2Q9NP85 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPHS2Q9NP85 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPHS2Q9NP85 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPHS2Q9NP85 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NPHS2Q9NP85 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NPHS2Q9NP85 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NPHS2Q9NP85 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPHS2Q9NP85 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms