Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CYP4F12Q9HCS2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4F12Q9HCS2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms