Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PRKRIP1Q9H875 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRKRIP1Q9H875 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRKRIP1Q9H875 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms