Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF41Q9H4P4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF41Q9H4P4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms