Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NYXQ9GZU5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms