Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCOLN1Q9GZU1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms