Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT23Q9C075 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT23Q9C075 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT23Q9C075 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT23Q9C075 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT23Q9C075 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms